W Wojewódzkim Szpitalu Zespolonym im. L. Rydygiera w Toruniu prowadzone są centralne rejestry i ewidencje:
- Rejestr skarg i wniosków,
- Rejestr zarządzeń wewnętrznych i poleceń służbowych,
- Rejestry umów,
- Rejestr kontroli wewnętrznych,
- Rejestr kontroli zewnętrznych,
- Rejestr korespondencji wpływającej,
- Ewidencja pracowników,
- Ewidencja środków trwałych,
- Rejestr podnoszenia kwalifikacji,
- Rejestr wyjść służbowych i prywatnych,
- Rejestr chorób zawodowych,
- Rejestr wypadków przy pracy,
- Rejestr szkodliwych czynników dla zdrowia,
- Rejestr zamówień publicznych.