Wojewódzki Szpital Zespolony im. L. Rydygiera w Toruniu jest jednym z twórców Narodowego Zasobu Archiwalnego, w związku z czym jego zasób jest kontrolowany przez Archiwum Państwowe w Toruniu. Archiwum Zakładowe wykonuje całość prac związanych z kształtowaniem narastającego zasobu, przyjmowaniem, ewidencjonowaniem, przechowywaniem oraz udostępnianiem materiałów archiwalnych i dokumentacji niearchiwalnej przekazywanej do Archiwum przez jednostki i komórki organizacyjne Szpitala.

Do Archiwum przyjmowane są akta typowe wytwarzane w trakcie działalności każdej instytucji oraz akta specyficzne. Dokumentacja specyficzna przekazywana jest przez jednostki i komórki działalności podstawowej Szpitala; jest to zarówno dokumentacja indywidualna jak i zbiorcza wewnętrzna. Po przekazaniu jej do archiwum, sprawdzana jest pod względem kompletności oraz układana zgodnie z obowiązującymi przepisami.

Magazyny archiwalne znajdują się we wszystkich lokalizacjach Wojewódzkiego Szpitala Zespolonego im. L. Rydygiera w Toruniu, tzn. przy:

  1. ul. Św. Józefa 53-59, 87-100 Toruń,
  2. ul. Konstytucji 3 Maja 42, 87-100 Toruń,
  3. ul. Konstytucji 3 Maja 42a, 87-100 Toruń,
  4. ul. Mickiewicza 24/26, 87-100 Toruń,
  5. ul. Krasińskiego 4/4a, 87-100 Toruń,
  6. ul. Grudziądzka 47-51, 87-100 Toruń.